【48812】Nature Communications PiSPA渠道：单细胞蛋白质组剖析新东西

  了“点取式”单细胞蛋白质组剖析（PiSPA）作业流程和根据纳晋级微流控液滴控制机器人完结了单细胞的精准捕获、前处理以及主动进样，并初次在单个哺乳动物细胞中完结了高达3000种蛋白质的超高定量深度现在，相关研讨效果以“ Pick-up single-cell proteomic analysis for quantifying up to 3000 proteins in a Mammalian cell ”为题在世界威望期刊《天然通讯》上宣布。

  更强壮的单细胞蛋白质组剖析东西：PiSPA作业流程单细胞蛋白质组学技能是近年来生命科学范畴研讨的热门。因单个细胞中的蛋白质含量极微（仅约0.2 ng）且无法扩增，单细胞蛋白质组剖析极具挑战性。现在传统蛋白质组剖析技能仅能在每个细胞中判定1000种左右的蛋白质，而这在单细胞剖析范畴显得有些“无能为力”。

  此外，传统的样本前处理操作大多在微晋级反响器中进行，在样品处理和搬运的进程中会呈现十分显着的样品丢失，这会约束单细胞蛋白质组学的判定深度，难以满意生命科学研讨的火急需求。

  “想要打破单细胞蛋白质组学判定深度的妨碍，有两种战略。一是在满足小的微反响器中进行样品前处理，使用微标准效应进步反响功率；二是将一切操作整合在一起，下降样品丢失，但这两种战略对技能与设备的要求都很高”，本项效果榜首完结人王宇博士解释道，“咱们使用微流控技能将商品化的内插管改造为阵列化的纳晋级微反响器，处理了纳晋级样品反响与主动进样的问题。PiSPA渠道可主动完结细胞捕获、样品前处理、色谱别离、质谱检测、数据处理等操作，逐渐下降了样品丢失。”

  “在研讨中，咱们将该渠道使用于三种哺乳动物细胞（HeLa、A549和U2OS细胞）的单细胞蛋白质组剖析，以及HeLa细胞搬迁进程中的细胞异质性研讨中，均完结了超高深度定量剖析”，王宇博士说。一起，搬迁细胞的单细胞蛋白质组剖析也证明了PiSPA渠道具有辨认细胞搬迁要害分子以及有价值靶点的使用潜力。

  单细胞的定量深度：从3000+走向全蛋白质组测序PiSPA渠道集成了根据序控液滴（SODA）技能的主动化液滴操作机器人，可以在“点取式”操作形式下完结纳晋级的细胞分选、多步样品前处理和主动进样操作。比较于其他单细胞剖析办法，

  。其次，PiSPA渠道选用针对单细胞样品的“定制化”剖析条件，完结了蛋白质判定深度的大幅度的进步，可以为生物医学研讨供给更多有用的根底数据。这些优势对推进单细胞蛋白质组剖析的实践推广使用具有极端重大意义。

  “现在的单细胞定量深度仅仅一个起点”，方群教授共享道，在该项研讨中，可从单个哺乳动物细胞中可定量多达3000种蛋白质，约占人类基因编码蛋白质总数（约20,000种）的15%，其判定深度已达到10年前单细胞转录组测序技能的附近水平。类比单细胞转录组测序技能的开展前史，能预见当时已处于单细胞蛋白质组剖析技能的迸发阶段，随技能的快速改造，单细胞的定量判定深度还将得到前所未有的提高。“这在某种程度上预示着单细胞蛋白质组学技能已进入在广泛的生物医学研讨范畴中实践使用的阶段。”

  。此外，在上述效果根底上，现在团队还在使用iChemFoundry渠道的主动化机器人技能和机器视觉技能构建能完结单细胞蛋白质组剖析悉数流程操作主动化的剖析渠道，很快会有新的效果发布，这些都将为人们了解生命活动中细胞异质性的改变带来更有力东西。

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